Partenaires

EDB
UPS CNRS ENFA



Rechercher

Sur ce site

Sur le Web du CNRS

Dernière mise à jour du site : vendredi 21 novembre 2014


Accueil du site > Le laboratoire > Annuaire > Chikhi Lounès

JPEG - 183 ko

Chikhi Lounès

Chargé de Recherche 1ère Classe - CNRS

Icone contact Email

Icone blog Site Personnel

Thèmes de recherche

  • Population and Conservation Genetics
  • Genetics of Structured Populations
  • Neolithic Transition

Recherches actuelles

Les données génétiques sont de plus en plus utilisées pour aborder de nombreuses problématiques qui vont de l’anthropologie à l’écologie. Mon travail de recherche s’inscrit dans ces problématiques. Je cherche à comprendre dans quelle mesure les données génétiques peuvent effectivement être utilisées aussi bien dans le domaine de la conservation que pour reconstruire l’histoire récente des populations humaines, ou de populations sauvages ou domestiques de différentes espèces animales.

Parcours de recherche

1988-1991 : Ingénieur INA Paris-Grignon (AgroParisTech)

1990-1991 : DEA de Biologie des Populations et Eco-éthologie (Univ. Rennes-Tours)

1991-1995 : Thèse de Doctorat en Génétique des Populations (Univ. Paris 6)
(Centre de recherche océanographique d’Abidjan, Univ. Montpellier 2, Station de Biologie marine de Sète)

1995-2002 : Post-doctorats (Padoue, Londres, Cardiff)

2002-2010 : Chargé de Recherche CNRS (Univ. Paul Sabatier, Toulouse)

• 2006 07-09 : Chercheur Invité à l’Instituto Gulbenkian de Ciência

• 2007-2009 : Mise à Disposition à l’Instituto Gulbenkian de Ciência

• 2006-2010 : Responsable du groupe Population and Conservation Genetics - (Instituto Gulbenkian de Ciência)

Mars 2011 : HDR

Bibliographie

Articles Récents

Goldstein, D.B., Chikhi, L. (2002). Human migrations and population structure : what we know and why it matters. Annual Review of Genomics and Human Genetics., 3 : 129-152.

Chikhi, L., Nichols, R.A., Barbujani G., Beaumont M.A. (2002) Y genetic data support the Demic diffusion model. . Proc. Natl. Acad. Sci, USA, 98 : 11007-11013.

Bentley, R. A., Chikhi, L., Price, T. D (2003). The Neolithic transition in Europe : comparing broad scale genetic and local scale isotopic evidence. Antiquity.Vol. 77 (295) : 63-66.

Dupanloup, I., Bertorelle, G., Chikhi, L., Barbujani, G. (2004) Estimating the impact of prehistoric admixture on the genome of Europeans. Molecular Biology and Evolution, 31(7) : 1361-1372

Goossens, B., Chikhi, L., Jalil, M.F., Ancrenaz, M., Lackman-Ancrenaz, I., Mohamed, M., Andau, P., Bruford, M.W. (2005). Patterns of genetic diversity and migration in increasingly fragmented and declining orang-utan populations from Sabah, Malaysia. Molecular Ecology 14 : 441-456.

Goossens, B.*., Chikhi, L.*., Ancrenaz, M., Lackman-Ancrenaz, I., Andau, M., Bruford, M.W. (2006). Genetic signature of anthropogenic population collapse in orang-utans. PLoS, Biology, 4(2) : 285-291. *Shared first authorship.

Barbujani, G., Chikhi, L. (2006). DNAs from the European Neolithic. Heredity, 97 : 84-85.

Bonhomme, M, Blancher, A., Cuartero S., Chikhi, L., Crouau-Roy, B. (2008) Origin and demographic history of the Mauritius macaque (M. fascicularis) : new insights from microsatellite data. Molecular Ecology, 17 : 1009-1019.

Radespiel, U., Rakotondravony, R., Chikhi, L., (2008) Natural and anthropogenic determinants of genetic structure in the largest remaining metapopulation of the endangered golden-brown mouse lemur, Microcebus ravelobensis. American Journal of Primatology, 70 : 1-11.

Olivieri, G., Sousa, V., Chikhi, L., Radespiel, U., (2008) from genetic diversity and structure to conservation : genetic signature of recent population declines in three mouse lemur species (Microcebus ssp.) Biological Conservation, 141 : 1257-1271.

Chikhi, L. (2008). How accurate can genetic data be ? Heredity, 101, 471-472.

Rasteiro, R., Chikhi, L. (2009). Revisiting the peopling of Japan : an admixture perspective. Journal of Human Genetics, 54,349-354.

Sousa, V., Fritz, M., Beaumont, M.A., Chikhi, L. (2009) Approximate Bayesian Computation without summary statistics : the case of admixture. Genetics, 181, 187-197.

Quéméré, E., Louis, E., Ribéron, A., Chikhi, L. Crouau-Roy, B. (2009). Non-invasive conservation genetics of the critically endangered golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli) : high diversity and significant genetic differentiation over a small range Conservation Genetics, 11(7) 675-68.

Craul, M., Chikhi, L., Sousa, V., Olivieri, G., Rabesandratana, A., Zimmermann, E., Radespiel, U. (2009). Influence of forest fragmentation on an endangered large-bodied lemur in northwestern Madagascar. Biological Conservation, 142 (12), 2862-2871.

Chikhi L (2009) Genetic data and story-telling : from Archeogenetics to Astrologenetics ? An update to “Clinal variation in the nuclear DNA of Europeans” By Chikhi, L., Destro-Bisol, G., Pascali, V., Baravelli V., Dobosz, M., Barbujani, G. Published in 1998 in Human Biology. Human Biology, 81, (5-6), 639-643.

Quéméré, E, Champeau J, Besolo, A, Rasolondraibe, E Rabarivola, C, Crouau-Roy, B Chikhi, L (2010) Spatial variation in density and total size estimates in fragmented primate populations : the golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli). American Journal of Primatology, 72,72-80.

Beaumont M, Nielsen R, Robert C, Hey J, Gaggiotti O, Knowles L, Estoup A, Panchal M, Corander J, Hickerson M, Sisson SA, Fagundes N, Chikhi L, Beerli P, Vitalis R, Cornuet JM, Huelsenbeck J, Foll M, Yang, Rousset F, Balding D, Excoffier L (2010) In defense of model-based inference in phylogeography. Molecular Ecology, 19 (3), 436-446.

Quéméré E, Crouau-Roy B, Rabarivola C, Louis EE Jr., Chikhi L (2010) Landscape genetics of an endangered primate species within its entire fragmented range. Molecular Ecology,19, 1606-1621.

Schneider, N, Chikhi, L, Currat, M, Radespiel, U (2010) Signals of recent spatial expansions in the grey mouse lemur (Microcebus murinus). BMC Evolutionary Biology, 10, 105-121.
 
Bruford, M.W., Ancrenaz, M., Chikhi, L., Lackman-Ancrenaz, I., Andau, M., Ambu, L., Goossens, B. (2010) Projecting genetic diversity and population viability for the fragmented orang-utan population in the Kinabatangan floodplain, Sabah, Malaysia. Endangered Species Research, 12 : 249–261.

Chikhi, L., Sousa, V., Luisi, P., Goossens, B., Beaumont, M.A., (2010) The confounding effects of population structure, genetic diversity and the sampling scheme on the detection and quantification of population size changes. Genetics, 186 : 983-995.